獸醫指70%以上的馬匹或多或少都有少許毛病。有些病患並不會對外公布，所以投注賽馬是有一定的風險。

沙入眼是很常見的事。在晨操，或跑泥地、草地賽事都會有沙入眼。

因馬匹是一隻眼著一隻跑，前面馬匹踢起了泥頭，後面的馬匹趕不及閉上眼睛，就會打了入眼。

若有沙打了入眼，馬匹會流眼水、眼紅、甚至眼腫。回到馬房一定會用清水洗眼。嚴重的會看醫生，用藥水洗眼，甚至會唧一些藥膏入眼。

被沙打入眼是馬匹跑不出水準的其中一個原因。

有些馬年紀漸長，因為過往曾經被沙打入眼而沒有發覺，久而久之視力變得模糊。競跑時變得單邊口，經常向內走或向外走，其實是有一隻眼睛看不清楚。

口部流血是很嚴重的事，是馬口受傷才會流血。主要原因有：

1. 因為馬bit收得太緊，夾著兩邊嘴角的肉，馬匹會覺得很不舒服，但騎師又不發覺。在用韁繩拉bit指揮馬走時，使馬匹很痛苦，一直磨擦，便會流血。

2. 因為騎師有意無意與馬角逐、鬥力，把「Give and Take」相反來做，因而不斷拉動馬bit扯向嘴角，亦會引致流血。

3. 因為馬匹把舌頭擱在馬bit上，當騎師把bit往後拉，就會把舌筋（脷筋）割損。這些馬匹在出賽時或需要考慮繫舌（綁脷）。

馬匹天生四肢較身軀比例小很多，四隻腳要支撐上千磅身體，尤其在奔馳時只以單腳輪流著地。因此馬的腳部有問題是一個通病。以下為常見腳患：

腳腫：腳筋會痛，影響行走。

脹筋（Sore Shins；俗稱疏仙）：手尾很長，難根治。大多數一生都不能康復，就此退役；有些會好轉，但跑不出往時水準。

踢傷：不論是被自己或是被其他馬踢傷。

爛蹄心：蹄甲中央潰爛，是很嚴重的事。

蛀甲：蹄甲因感染腐爛，同樣是嚴重問題。需要用蠟去修補。

爆甲：蹄甲爆裂，是非常嚴重的問題，是很痛苦的事。因為蹄甲避不免著地，每次著地都會頂著自己，走起路來十分辛苦。嚴重者需要停操；輕微的練馬師也不敢快操、不敢在硬地操。

葫蘆骨發大：葫蘆骨（Fetlock Joint）是馬蹄對上的一個關節，關節上面的軟骨發大，引致關節腫脹疼痛。有些馬久了就不會痛，但關節骨發大了就不會縮小。

蹄甲空殼：蹄甲大，肉小。蹄甲著地時沒有肉來支持，會感到疼痛。

蹄甲兩邊肉凸出：與蹄甲空殼相反，蹄甲小，肉多。著地時蹄甲壓著肉，是相當痛楚，容易受傷出血。

馬匹流鼻血並不是鼻腔流血，而是肺出血，血液經氣管在鼻腔湧出。

流鼻血是極嚴重的事，代表肺部出了問題。競賽時需要強大的心肺功能，流過鼻血的馬往往令競賽生涯響起警號。

通常我們知道的只是在出賽、試閘或晨課流鼻血，被人發現了就會公布；有些馬在劇烈運動辛苦過後沒有即時流鼻血，而是回到馬房裡血才流出來，那就沒有外人知道。

痰多、喘鳴、氣管收窄皆會導致馬匹換氣不足，影響發揮。

傷風會被馬伕、幕後人看見，因為會流鼻水、神情呆滯；但發熱則很難發現，要時常探熱，並留意其動態。

若馬匹突然不想郁動、呆呆滯滯、胃口變差，則表示身體不舒服。

山頭是指韁繩對落，馬鞍最前面拱起的馬背，亦即是肩胛骨的位置。

山頭位置皮膚很薄，若馬肚帶收得不緊，導致馬鞍有虛位。有些騎功不好的騎師，推騎時靠兩個膝蓋夾著馬背推，把馬鞍都一起推移，不斷磨擦山頭，山頭就會破損、脫皮、流血，是很痛苦的事。

山頭一旦受損便不能上鞍，需要停止策騎和操練。要塗藥膏和休息。

馬匹奔跑時會上下擺動。在出賽或晨操時，騎師或騎馬人的擺動節奏（up and down）不是跟馬匹的節奏一致，用身體重量不斷坐和打落馬背，稱為打樁，導致腰部被打傷。

馬背受傷需要用氈熱敷、按摩、以及塗藥膏。

皮膚出現一粒粒、一點點、或一塊塊。有時會痕癢，影響出賽表現。

因汗腺痿縮，皮膚不能排汗。這些馬在炎熱的天氣很容易中暑，要減少出賽及操練，並盡量留在有冷氣或空氣流通的地方。

生蟲會令食慾降低、不長肌肉，馬匹變得乏力、毛色暗啞。需要吃杜蟲藥，吃了杜蟲藥會非常影響體力。

有的馬因為肛門痕癢，會在牆壁磨擦雙臀而起了白印。

腹瀉（肚痾）即是排便並非正常的軟條狀，對作戰能力有一定影響。如果是水質（痾屎水）就失去作戰能力。

尾毛脫落可能是荷爾蒙失衡，一般不影響作戰能力，但也影響外觀，不是好現象。

蹄甲邊生倒刺，表示身體弱，健康出了問題。

在炎熱的天氣或在運動過後，由於身體需要排熱，出汗是正常的現象。若然馬匹無故出汗，則代表有異常。

正常的汗液是無色的，因為食料的緣故，有些馬流出來的汗是白色的膠狀，稱為白汗（白泡），在遠處清晰可見。

根據白汗的形態，可以分為膏、水、汁三款。

膏狀的白汗，黏稠狀，掛在身體上不易掉落，這類是正常的排汗。

水狀的白汗，是冒出來一顆顆珠狀的，表示馬匹精神緊張、膽小，或體魄弱。

汁狀的白汗，一滴一滴滴下地面，表示馬匹情緒不安，受事物影響所致。